Nature：肠道微生物代谢产物新系统，促进HDAC3酶活性

哺乳动物肠道和对其有益的常与病原体的共同进化随之而来了肠道-病原体父子关系的发展。表观表型修饰使得哺乳动物细胞会能够为基础外界生态信号，加强细胞会对生态的适应性。但是直至以来常与的肠胃病原体；也的多种信号通路和多种生态信号是如何精密调控的还不足见清楚。

肠胃滤泡坐落病原体群和肠道彼此间的界面，加强这两项第二道的形成，在卫生时期和损伤时期对肠胃上皮同步进行补充。维持肠胃滤泡分化成流程中都会有多种表观表型系统参与其中都会，其中都会HDACs的隐含对于肠胃稳态非常这两项。肠胃病原体；也的短链不饱和脂肪酸甲酸矿（Butyrate）在灌注抑制HDAC活性，甲酸矿处理事件后的肠胃组织滤泡中都会HDAC活性下降。在乳胶狸中都会去除产甲酸矿的肠胃病原体都会抑制肠胃滤泡中都会HDAC的活性。这些结果都概述肠胃病原体；也的甲酸矿抑制HDAC的活性。但是肠胃病原体与鸟嘌呤透代谢物物选择性彼此间的调控系统是怎样的还众说纷纭。

近日，美国辛辛那提儿童医院医疗中都会心Theresa Alenghat该中心在Nature杂志上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut，发掘出肠胃病原体；也的半乳糖氨基矿能够抑制肠胃内鸟嘌呤透代谢物物酶HDAC3的活性从而加强肠胃滤泡的修补，揭开了肠道对于肠胃病原体信号响应的具体内容系统。

为了揭开肠胃病原体衍生代谢物产物与表观表型信号彼此间的父子关系，原作者们对野生型以及肠胃滤泡HDAC3敲除小狸中都会的HDAC活性进性测定，发掘出野生型对照组小狸中都会的HDAC3隐含正常人并且具有利于的选择性，但是肠胃滤泡HDAC3敲除小狸则相反。原作者们想并不知道HDAC3是否都会特异性抑制肠胃病原体敏感的信号可借。原作者们发掘出HDAC1与HDAC2在肠胃滤泡中都会也有隐含，但并无法免除肠胃滤泡中都会HDAC3隐含的缺失。而且在对乳胶狸和肠胃滤泡HDAC3敲除小狸中都会的肠胃滤泡施用HDAC广谱抑制剂处理事件后，发掘出在HDAC3敲除后其他种类的HDACs仍然具活性。这些结果概述肠胃病原体加强滤泡中都会HDAC3在正常人肠胃稳态中都会的选择性。

为了破译肠胃病原体激活HDAC3的具体内容系统，原作者们对乳胶狸和正常人培养的小狸中都会肠胃滤泡中都会的转录谱同步进行求解。原作者们发掘出在肠胃病原体发挥作用的滤泡中都会与半乳糖氨基代谢物相关的基因被广泛可借隐含。长处的研究发掘出半乳糖三氨基（Inositol trisphosphate）都会通过强化HDAC3与激活肽的相互作用来增大HDAC3的活性。原作者们发掘出外加半乳糖三氨基的确都会特异性增大HDAC3-NcoR重鸟嘌呤的活性，NcoR肽对于HDAC3的透代谢物物选择性非常这两项。

进一步地，原作者们想并不知道乳胶狸与对照组的小狸肠胃彼此间半乳糖三氨基总体是否发挥作用关联性。原作者们发掘出对照组小狸中都会无论是肠腔还是肠胃滤泡中都会半乳糖三氨基的总体都许多现代高于乳胶狸，概述肠胃病原体的发挥作用加强半乳糖三氨基总体的增大。为了评估半乳糖三氨基对于肠胃滤泡中都会HDAC3活性的影响，原作者们对肠胃滤泡中都会的HDAC3肽同步进行纯化并与半乳糖三氨基同步进行共同孵蛋，发掘出半乳糖三氨基的确能够增大内源HDAC3的活性。而且甲酸甲基引致的HDAC3活性的抑制也可以被半乳糖三氨基所拮抗。另外，原作者们还发掘出常与的肠胃病原体都会通过半乳糖六氨基（Phytate）代谢物途径加强肠胃滤泡中都会的HDAC3的功能。与半乳糖三氨基相似，半乳糖六氨基也都会可借肠胃滤泡中都会的HDAC3的活性。

为了测定肠胃病原体半乳糖六氨基依赖的代谢物对于HDAC活性的影响，原作者们对定植野生型以及半乳糖六天冬氨酸缺失型大肠杆菌的小狸同步进行分析方法。原作者们发掘出定植半乳糖六天冬氨酸正常人隐含大肠杆菌的小狸相比较于乳胶狸以及半乳糖六氨基缺失型大肠杆菌小狸的半乳糖三氨基总体升高。对小狸同步进行右旋糖酐甲基钠（Dextran sodium sulfate， DSS）处理事件后，都会可借小狸产生肠胃结核病。为了测定半乳糖三氨基在DSS处理事件可借的肠胃结核病中都会的作用，原作者们对乳胶狸施用半乳糖三氨基后发掘出半乳糖三氨基能够加强肠胃从结核病中都会恢复并增大乳胶狸的更长。DSS可借的高血压类似于病患者中都会溃疡性高血压。为了进一步确认肠胃病原体代谢物产物的功能，原作者们对人类文明为基础病原体组学构想（Integrative Human Microbiome Project）中都会的卫生试样以及溃疡性高血压患者的样品同步进行测定，发掘出在溃疡性高血压病患者肠胃中都会半乳糖六天冬氨酸的丰度远最低卫生试样之中都会，概述半乳糖六氨基对于肠胃损伤修补是必须的。

总的来说，Alenghat该中心的工作发掘出相比较于乳胶狸，肠胃病原体发挥作用的小狸中都会HDAC3活性许多现代减低，这一减低是通过常与的肠胃病原体比如大肠杆菌半乳糖六氨基以及半乳糖三氨基的代谢物形成的。另外，半乳糖三氨基都会可借病患者；也的肠胃类器官的土壤、刺激HDAC3依赖的基因隐含以及拮抗甲酸甲基引起的肠胃土壤抑制，都会加强肠胃结核病中都会滤泡的修补。因此，原作者们鉴定发掘出了HDAC3作为肠道响应多种肠胃病原体信号的汇聚表观或多或少的关键性功能，揭开了肠胃病原体、表观或多或少以及病原体代谢物产物在肠胃上皮以及肠胃结核病中都会的关键性调控和修补作用。

原始出处：

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.